Projektet bör ha en separat bokföring och alla verifikat bör sparas (åtminstone till år 2019, så som också alla övriga dokument som berör projektet). Om projektet bokförs med den sökandes ordinarie bokföring bör man ha ett eget kostnadsställe/konto.

Det rekommenderas att bokföringen sköts av en yrkesbokförare eller en bokföringsbyrå. Då man väljer bokförare bör man beakta bokförarens erfarenhet av projektbokföring samt kostnaderna för bokföringen. Det är bäst att begära offerter av flera bokföringsbyråer/bokförare (kom ihåg även att konkurrensutsätta köptjänsterna) och offerterna skall sparas i samband med de övriga handlingarna.

Skäliga bokföringskostnader är godtagbara kostnader i utvecklings- och investeringsprojekt.

Det är bra att göra kontokartan enligt de kostnadsställen som nämns i stödbeslutet.  Endast de skäliga kostnader som uppkommit enligt projektplanen kan sättas på projektet och alla kostnader skall kunna bekräftas och deras koppling till utförandet av projektet skall kunna klargöras.

På kostnader som understöds skall finnas specificerade fakturor och bevis på att den betalats, eller om betalningen inte grundar sig på en faktura, ett specificerat kvitto.  På fakturan eller kvittot bör skrivas eller stämplas "Projektnummer" (från ELY-Centralens beslut). Av betalningsverifikatet bör framgå i detalj anskaffningen.  Understöd utbetalas inte förrän kostnaden är bokad i bokföringen bl.a. så att omsättningsskatten är separerad.

(Obs! Reglerna och förordningarna kan ändras under programperioden!)